马寅初的经济学理论是与时俱进的。他建国前的许多著述，是对旧中国经济情况和西方经济学说研究的重要记录，是研究我国经济思想史的可贵资料；建国后的论著，大部分是对我国社会主义革命和建设问题研究的成果，见地新颖，贡献突出。

　　1916至1927年，马寅初主要结合中国实际情况引进西方经济学知识，诸如汇兑、银行等理论，对中国经济学的学科建设起到了一定的促进作用。

　　1928年至1937年，马寅初通过《中国经济改造》阐述其德国国家主义的倾向。

　　抗日战争时期，从战时税收制度、稳定币值、战时货币问题分析了战时经济。

　　1941-1945年被软禁期间，马寅初作《通货新论》解决战后通货膨胀问题。

　　解放后，马寅初提出综合平衡理论，为社会主义建设建言献策。50年代初期，他发表了《我国1952年度国家财政收支预算的优越性的特点》《1953年国家财政收入预算的特点》等文，阐述了社会主义财政预算与资本主义财政预算的本质区别。1955年，我国发行新人民币，他撰写了《新中国货币制度的特点及其优越性》一文，用不同社会制度下新旧币制对比的方法，论述了我国货币改革的重要性及其意义。

　　1956年后，马寅初发表了《联系中国实际来谈谈综合平衡理论和按比例发展规律》等文章。在文章中，他根据国民经济各部门之间的内在联系，从我国第一个五年计划执行过程中存在的问题出发，明确提出了要使国民经济有计划高速度地发展，必须对各部门、各环节进行综合平衡，使国民经济各部门之间在不断发展变化中保持一定的比例关系。